Cellsorter高速自动细胞分选-如何处理图像以得到需要拣选的细胞
cellsorter高速自动细胞分选
-如何处理图像以得到需要拣选的细胞
打开cellsorter软件的显微镜控制窗口，转到“分析”窗口，以手动或自动检测图像中的细胞。单击“检测参数”按钮后，可以调整自动细胞检测算法的参数。
为了检测相衬或荧光显微图像中的细胞，cellsorter软件提供了两种自动算法：直方图中值方法应用标准图像处理步骤以及基于中值的阈值进行对象检测，以及局部方差方法。两种方法都有3个输入参数：分别要检测的小和most像元大小以及直方图中值方法的阈值和局部方差方法的灵敏度。
高阈值或低灵敏度意味着更少的检测到的细胞。操作员必须针对实际的显微图像优化阈值和灵敏度值，以减少假阴性和假阳性检测的次数。错误的检测可以手动纠正。
检测速度取决于计算机。具有4gb ram的奔腾双核2.1 ghz处理器每秒可以分析4个微观图像，这意味着100平方毫米扫描面积可以在大约25秒内分析培养皿覆盖100张图像的区域。也可以通过使用pc鼠标单击单元格来手动执行检测。检测到的细胞在图像中用绿色框表示。
在检测到相衬图像中的所有细胞之后，操作员可以再次以荧光模式扫描相同区域以检测荧光细胞。可以加载先前以相衬模式扫描的细胞位置，并在荧光图像中指示。为了避免拾取未标记的单元格太靠近标记的单元格，用户可以选择排除相邻比排序分辨率更近的单元格。
在检测到荧光细胞并排除相邻细胞之间的距离小于分选分辨率后，操作员可以进入分选窗口。在这里，根据系统算法来计算访问要排序的单元格的短路径。对于100个和1,000个单元，计算分别花费了大约0.2秒和6.0秒。在一个拾取动作之前对活动单元进行了调整，5分钟。
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高阈值或低灵敏度意味着更少的检测到的细胞。操作员必须针对实际的显微图像优化阈值和灵敏度值，以减少假阴性和假阳性检测的次数。错误的检测可以手动纠正。
检测速度取决于计算机。具有4gb ram的奔腾双核2.1 ghz处理器每秒可以分析4个微观图像，这意味着100平方毫米扫描面积可以在大约25秒内分析培养皿覆盖100张图像的区域。也可以通过使用pc鼠标单击单元格来手动执行检测。检测到的细胞在图像中用绿色框表示。
在检测到相衬图像中的所有细胞之后，操作员可以再次以荧光模式扫描相同区域以检测荧光细胞。可以加载先前以相衬模式扫描的细胞位置，并在荧光图像中指示。为了避免拾取未标记的单元格太靠近标记的单元格，用户可以选择排除相邻比排序分辨率更近的单元格。
在检测到荧光细胞并排除相邻细胞之间的距离小于分选分辨率后，操作员可以进入分选窗口。在这里，根据系统算法来计算访问要排序的单元格的短路径。对于100个和1,000个单元，计算分别花费了大约0.2秒和6.0秒。在一个拾取动作之前对活动单元进行了调整，5分钟。
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