琼脂糖核酸电泳介绍

琼脂糖核酸电泳步骤
1. 用蒸馏水将制胶模具和梳子冲洗干净,放在制胶平板上,封闭模具边缘,架好梳子;
2. 根据欲分离dna片段大小用凝胶缓冲液配制适宜浓度的琼脂糖凝胶:准确称量琼脂糖干粉,加入到配胶用的三角烧瓶内,定量加入电泳缓冲液(一般
20~30 ml);
3. 放入到微波炉内加热熔化。冷却片刻,加入一滴荧光染料,轻轻旋转以充分
混匀凝胶溶液,倒入电泳槽中,待其凝固;
4. 室温下30~45 分钟后凝胶全凝结, 小心拔出梳子, 将凝胶安放在电泳槽内;
5. 向电泳槽中倒入电泳缓冲液,其量以没过胶面 1mm为宜,如样品孔内有气
泡,应设法除去;
6. 在dna 样品中加入10×体积的载样缓冲液(loading buffer),混匀后,用枪
将样品混合液缓慢加入被浸没的凝胶加样孔内;
7. 接通电源,红色为正极,黑色为负极,切记dna 样品由负极往正极泳动 (靠
近加样孔的一端为负)。一般60 ~100v电压,电泳20 ~40min即可;
8. 根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳;
9. 电泳完毕, 关上电源,在凝胶成像仪上观察电泳带及其位置,并与核酸分子
量标准marker比较被扩增产物的大小。
琼脂糖凝胶浓度与线形dna 的最佳分辨范围
琼脂糖凝胶浓度
线形dna 的最佳分辨范围(bp)
0.5%
1,000 ~30,000
0.7%
800 ~12,000
1.0%
500 ~10,000
1.2%
400 ~7,000
1.5%
200 ~3,000
2.0%
50 ~2,000
胶回收纯化dna
1. 琼脂糖电泳,将特异电泳带用刀切下放入到ep管中,称琼脂糖带的重量;
2. 按照每100mg 加400µl 的量加入bindingbuffer,放入到ep管振荡器中,45℃~
55℃温育振荡,直到所有的琼脂糖都溶解(大概要5 分钟);
3. 取出纯化柱,将上述溶解液转移至柱中,室温下放置2分钟, 8,000rpm 离心
1 分钟,弃ep管中的液体,将纯化柱放回ep 管中;
4. 加500µl的washbuffer至柱中, 8,000rpm 离心1分钟。弃管中的溶液;
5. 重复操作4步的操作1次,最后将纯化柱放入ep管中10,000rpm 离心30秒,
除去痕量的washbuffer;
6. 将纯化柱放入一个新的ep管。加30~40µl h2o或者elutionbuffer至纯化柱膜的中央,在37℃或50℃下放置2 分钟, 10,000rpm离心1 分钟洗脱dna,将
ep管中的dna 溶液放在-20℃保存。
7. 注:若想要不电泳而直接纯化dna 溶液,只需要在第2步中按100µl液量加400µl的bindingbuffer,其余的步骤不变。

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