病毒研究用水系列四：测序仪用水对结果的影响
基因测序技术是一种基因检测技术，也被称为dna测序技术，是进行分子生物学研究和基因改造的基础，也是解锁人类生命奥秘的重要方式之一。基因测序技术发展了40余年，已在众多领域被广泛应用，包括生物的基因组图谱绘制、物种进化演替过程、表观遗传学、疾病相关基因的确定和诊断等等。近年来，基因测序相关产品和技术由实验室研究演变到临床使用，为我们理解人类生物学特征和疾病，评估遗传疾病提供了关键性信息，所以说基因测序技术是下一个改变世界的技术毫不为过。
在疫情期间，这项技术得到了更多人的关注。疫情爆发初期，在不到一个月的时间内，通过基因测序技术，病毒的基因组序列被公布，为分析病毒的进化来源、致病机制提供了一手资料。不少也发起了患者基因测序计划，以了解个人基因对病毒感染反应的影响，这项研究的数据将为患者护理及药物处方提供信息，未来还可以帮助疫苗设计，从而拯救更多生命。
整个测序环节中，从样品收集到上机测序，水贯穿了包括测序仪的日常清洗维护和试剂配制在内的每一个环节。作为一个*的基础试剂，水的品质对终测序结果会产生显著影响。水中的杂质，如无机盐、有机物、核酸酶、颗粒物等，不仅会污染设备，缩短测序仪毛细管的使用寿命，而且还会降低dna聚合酶的活性，终干扰测序结果的准确性。
下面这些基因测序经常遇到的问题很有可能是使用的水有问题，快来看看你有没有中招…
q1：dna测序样品用什么溶剂溶解比较好？
溶解dna测序样品，使用超纯水溶解较好。
原因：dna的测序反应的原理其实就是taq酶的聚合反应，需要一个适合的酶反应条件。如果溶解dna样品的溶液含有过多的盐，会影响测序反应体系，造成taq酶的聚合性能下降，干扰测序反应甚至无法产生信号。
纯水应用tips:超纯水机采用基因测序超纯化柱，rephile 配方填料的低镁型纯化柱，可以特异性去除水中的镁离子，降低空白本底对测序反应体系的影响。
q2：测序结果怎么没有峰图呢？
原因：模板被降解，罪魁祸首可能是测序使用的水中含有核酸酶。
纯水应用tips:制备超纯水的超纯水机需要带有终端滤器，如乐枫生物的rephibio终端滤器，可以去除dna酶和rna酶。
q3：为什么测序峰图出现了“瀑布效应”？
“瀑布效应”是基线突然从高处下降的现象。
原因：样品被有机物污染，有机物会被激发产生荧光，抬高基线。
纯水应用tips:使用带有toc检测系统的超纯水机,如乐枫genie系列智能超纯水系统，有机物含量低于5 ppb，采用全氧化法设计的toc在线监测系统，在线监测toc含量，符合ispe制药工程指南 / 美国药典usp等标准对于toc检测的要求。
q4：“钉子峰”如何避免？
“钉子峰”是a、t、c、g四个颜色的峰都被突然拔起，形成的尖锐峰形。
原因：溶液中可能存在气泡或者颗粒，气泡和颗粒对激光全反射，形成“钉子峰”。
纯水应用tips:纯水机取水口配备0.22μm的终端滤器，测序之前使用超声波对超纯水进行脱气可以有效地防止“钉子峰”。
乐枫生物genie系列智能纯水系统以稳定的水质、智能的操作系统充分满足基因测序用水需求，在诸多应用到测序仪的实验室常常会看到乐枫生物genie系列智能超纯水系统的身影。华大基因海外“火眼实验室”采用的超纯水机是genie 系列的超纯水系统。
关于乐枫生物
乐枫生物(rephile bioscience，ltd.) 是一家专业从事水纯化和实验室分离纯化产品研发、设计和制造的企业，为高科技生物技术和生命科学领域的用户服务。乐枫公司着眼于发展，在中国、美国、法国、印度、南非等近20个建立了销售机构，同时也为大型公司提供oem和odm，产品销往包括欧美的近100个。成立十余年，乐枫持续投入研发，创立出了自己的产品品牌rephile（瑞枫），推出了多个新概念产品- 无线连接的genie系列纯水系统和智能型大流量纯水工作站super-genie等。目前乐枫纯化柱填料配方齐全，也提供多款密理博纯水系统的兼容耗材。
关键词：纯水，超纯水，实验室，genie纯水机，基因测序，测序峰图，乐枫
关注rephile 公众号：乐枫纯水，关注乐枫动态！
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整个测序环节中，从样品收集到上机测序，水贯穿了包括测序仪的日常清洗维护和试剂配制在内的每一个环节。作为一个*的基础试剂，水的品质对终测序结果会产生显著影响。水中的杂质，如无机盐、有机物、核酸酶、颗粒物等，不仅会污染设备，缩短测序仪毛细管的使用寿命，而且还会降低dna聚合酶的活性，终干扰测序结果的准确性。
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原因：模板被降解，罪魁祸首可能是测序使用的水中含有核酸酶。
纯水应用tips:制备超纯水的超纯水机需要带有终端滤器，如乐枫生物的rephibio终端滤器，可以去除dna酶和rna酶。
q3：为什么测序峰图出现了“瀑布效应”？
“瀑布效应”是基线突然从高处下降的现象。
原因：样品被有机物污染，有机物会被激发产生荧光，抬高基线。
纯水应用tips:使用带有toc检测系统的超纯水机,如乐枫genie系列智能超纯水系统，有机物含量低于5 ppb，采用全氧化法设计的toc在线监测系统，在线监测toc含量，符合ispe制药工程指南 / 美国药典usp等标准对于toc检测的要求。
q4：“钉子峰”如何避免？
“钉子峰”是a、t、c、g四个颜色的峰都被突然拔起，形成的尖锐峰形。
原因：溶液中可能存在气泡或者颗粒，气泡和颗粒对激光全反射，形成“钉子峰”。
纯水应用tips:纯水机取水口配备0.22μm的终端滤器，测序之前使用超声波对超纯水进行脱气可以有效地防止“钉子峰”。
乐枫生物genie系列智能纯水系统以稳定的水质、智能的操作系统充分满足基因测序用水需求，在诸多应用到测序仪的实验室常常会看到乐枫生物genie系列智能超纯水系统的身影。华大基因海外“火眼实验室”采用的超纯水机是genie 系列的超纯水系统。
关于乐枫生物
乐枫生物(rephile bioscience，ltd.) 是一家专业从事水纯化和实验室分离纯化产品研发、设计和制造的企业，为高科技生物技术和生命科学领域的用户服务。乐枫公司着眼于发展，在中国、美国、法国、印度、南非等近20个建立了销售机构，同时也为大型公司提供oem和odm，产品销往包括欧美的近100个。成立十余年，乐枫持续投入研发，创立出了自己的产品品牌rephile（瑞枫），推出了多个新概念产品- 无线连接的genie系列纯水系统和智能型大流量纯水工作站super-genie等。目前乐枫纯化柱填料配方齐全，也提供多款密理博纯水系统的兼容耗材。
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